More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1126 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
340 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  85.25 
 
 
336 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  82.84 
 
 
327 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  83.14 
 
 
327 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  82.3 
 
 
356 aa  584  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  79.35 
 
 
331 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  76.33 
 
 
327 aa  551  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.18 
 
 
341 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.6 
 
 
326 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  69.82 
 
 
330 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.93 
 
 
330 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.93 
 
 
330 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  69.23 
 
 
330 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  68.96 
 
 
330 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  69.25 
 
 
330 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
330 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  69.25 
 
 
330 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  68.53 
 
 
330 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
330 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  68.96 
 
 
330 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  69.25 
 
 
330 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  68.96 
 
 
330 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
330 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
330 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  68.96 
 
 
330 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  67.46 
 
 
330 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.06 
 
 
327 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.93 
 
 
346 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.34 
 
 
330 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  68.64 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  66.87 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.99 
 
 
327 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.08 
 
 
334 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  60.65 
 
 
339 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.09 
 
 
336 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.79 
 
 
341 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.46 
 
 
328 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.46 
 
 
328 aa  408  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  57.86 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.16 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.16 
 
 
328 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.86 
 
 
328 aa  401  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.27 
 
 
328 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  59.36 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  58.48 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.18 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  57.27 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.68 
 
 
328 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.68 
 
 
328 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.68 
 
 
328 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.68 
 
 
328 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.38 
 
 
328 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.49 
 
 
328 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.38 
 
 
329 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.19 
 
 
328 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.9 
 
 
328 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.75 
 
 
338 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  61.59 
 
 
302 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.35 
 
 
335 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  58.28 
 
 
332 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  58.28 
 
 
332 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.01 
 
 
338 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.35 
 
 
329 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.35 
 
 
326 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.03 
 
 
324 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.72 
 
 
335 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.51 
 
 
335 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  56.42 
 
 
331 aa  364  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.17 
 
 
325 aa  352  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.48 
 
 
325 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.62 
 
 
325 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.33 
 
 
325 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.31 
 
 
333 aa  339  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50 
 
 
324 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  52.08 
 
 
330 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.15 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.4 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  49.41 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  46.73 
 
 
328 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.93 
 
 
334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  47.06 
 
 
333 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.9 
 
 
338 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.35 
 
 
314 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45 
 
 
331 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  46.29 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.15 
 
 
314 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.37 
 
 
331 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.65 
 
 
330 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.65 
 
 
331 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 
342 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.63 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0327  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.01 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0275  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.49 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.951792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0261  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.49 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.33 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0227  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.38 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0214  fumarylacetoacetase (fumarylacetoacetate hydrolase)  27.38 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0241  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.38 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0254  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.38 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5069  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.87 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>