94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2715 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  100 
 
 
330 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  80.91 
 
 
331 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.25 
 
 
335 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.9 
 
 
338 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.94 
 
 
336 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.59 
 
 
341 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.06 
 
 
335 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.47 
 
 
338 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.53 
 
 
333 aa  265  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.02 
 
 
335 aa  255  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.44 
 
 
336 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.59 
 
 
326 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.99 
 
 
330 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.99 
 
 
330 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.99 
 
 
330 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.99 
 
 
330 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
330 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.64 
 
 
328 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
330 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
330 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.47 
 
 
328 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.56 
 
 
330 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.19 
 
 
330 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.19 
 
 
327 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.47 
 
 
328 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.19 
 
 
327 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.59 
 
 
328 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.15 
 
 
330 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.69 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.18 
 
 
328 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.3 
 
 
328 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.39 
 
 
330 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.18 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.18 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.18 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.97 
 
 
345 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39 
 
 
328 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  42.23 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  39.83 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.76 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.6 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.3 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.01 
 
 
328 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.65 
 
 
340 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.56 
 
 
302 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.72 
 
 
328 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.01 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.43 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  40.23 
 
 
332 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  40.23 
 
 
332 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.88 
 
 
336 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.76 
 
 
329 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  40.42 
 
 
330 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.4 
 
 
326 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  40.47 
 
 
331 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.37 
 
 
341 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.78 
 
 
327 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.78 
 
 
327 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.4 
 
 
346 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.82 
 
 
330 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.95 
 
 
329 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.47 
 
 
356 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.82 
 
 
330 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.88 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.44 
 
 
325 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.02 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  39.58 
 
 
327 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.41 
 
 
325 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.71 
 
 
325 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.71 
 
 
325 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.76 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.72 
 
 
334 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.89 
 
 
334 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.44 
 
 
324 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40 
 
 
330 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.8 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.9 
 
 
338 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  37.31 
 
 
325 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  37.69 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 
331 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  37.95 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.25 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  38.05 
 
 
328 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.12 
 
 
331 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.35 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.82 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5055  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  29.26 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.698058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.32 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25.91 
 
 
644 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2235  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.27 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117437  hitchhiker  0.00077103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>