157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0613 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
334 aa  683    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  67.75 
 
 
331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  67.98 
 
 
327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.28 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  66.76 
 
 
356 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  67.67 
 
 
327 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  66.08 
 
 
336 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.9 
 
 
341 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.08 
 
 
340 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.96 
 
 
327 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.82 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.31 
 
 
346 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.69 
 
 
330 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  56.8 
 
 
330 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.1 
 
 
330 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.01 
 
 
327 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.31 
 
 
327 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.4 
 
 
330 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.4 
 
 
330 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.23 
 
 
330 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.8 
 
 
330 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  57.1 
 
 
330 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.99 
 
 
330 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.51 
 
 
330 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.4 
 
 
330 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.51 
 
 
330 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.51 
 
 
330 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.51 
 
 
330 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.21 
 
 
330 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.22 
 
 
330 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.4 
 
 
330 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  56.63 
 
 
330 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.93 
 
 
330 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.89 
 
 
328 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.49 
 
 
328 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.59 
 
 
328 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.89 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.59 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.29 
 
 
328 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.89 
 
 
328 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
328 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
328 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
328 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
328 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.59 
 
 
328 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.99 
 
 
328 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  49.13 
 
 
339 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.69 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.26 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.78 
 
 
328 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  46.69 
 
 
345 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.08 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.43 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.54 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  46.99 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.39 
 
 
341 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.97 
 
 
336 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.65 
 
 
329 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  47.77 
 
 
332 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  47.77 
 
 
332 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.08 
 
 
335 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.76 
 
 
326 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.78 
 
 
338 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  46.83 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.39 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.25 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  47.31 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.99 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.22 
 
 
325 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  46.45 
 
 
302 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.22 
 
 
325 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.59 
 
 
330 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.92 
 
 
325 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.22 
 
 
338 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.78 
 
 
327 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  45.18 
 
 
325 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.37 
 
 
324 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  45.65 
 
 
333 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.09 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.32 
 
 
334 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.74 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.34 
 
 
331 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.49 
 
 
338 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.77 
 
 
333 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  44.05 
 
 
331 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.46 
 
 
314 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.86 
 
 
331 aa  225  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.72 
 
 
330 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  35.88 
 
 
331 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.2 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.58 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.96 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0275  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.19 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.951792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0261  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  26.19 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2039  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.54 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630421  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3932  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.44 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.707653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5980  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  29.19 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0227  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.32 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0241  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.32 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0214  fumarylacetoacetase (fumarylacetoacetate hydrolase)  27.32 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>