More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2396 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
331 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  75.84 
 
 
333 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.27 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  63.5 
 
 
325 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  65.03 
 
 
335 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.08 
 
 
330 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.31 
 
 
314 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.47 
 
 
314 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.24 
 
 
328 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
328 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.93 
 
 
328 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
328 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
328 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
328 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.53 
 
 
331 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.71 
 
 
328 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.31 
 
 
325 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
328 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.09 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.29 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.9 
 
 
328 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50 
 
 
325 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.4 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.09 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.4 
 
 
328 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.29 
 
 
328 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  47.84 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.71 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.07 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  46.48 
 
 
332 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  46.48 
 
 
332 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.91 
 
 
327 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.6 
 
 
327 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45 
 
 
340 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.25 
 
 
329 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  46.06 
 
 
330 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.92 
 
 
338 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.69 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.99 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.3 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.15 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.09 
 
 
326 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.7 
 
 
356 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.12 
 
 
331 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.63 
 
 
326 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.37 
 
 
330 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  45.37 
 
 
330 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  48.92 
 
 
331 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.37 
 
 
330 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.75 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.24 
 
 
324 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.68 
 
 
330 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.68 
 
 
330 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.06 
 
 
330 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.06 
 
 
330 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.06 
 
 
330 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.06 
 
 
330 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.06 
 
 
330 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.06 
 
 
327 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.15 
 
 
330 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.37 
 
 
330 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.85 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.06 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.94 
 
 
336 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.46 
 
 
330 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.75 
 
 
346 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.69 
 
 
345 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.51 
 
 
329 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.15 
 
 
338 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.94 
 
 
345 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.92 
 
 
335 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  44.48 
 
 
331 aa  255  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.33 
 
 
324 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.66 
 
 
341 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  43.45 
 
 
339 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.64 
 
 
336 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.67 
 
 
327 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.37 
 
 
335 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.66 
 
 
336 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.79 
 
 
302 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.34 
 
 
334 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.28 
 
 
338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.2 
 
 
334 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.72 
 
 
333 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.29 
 
 
335 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  37.12 
 
 
328 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.12 
 
 
330 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.88 
 
 
331 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.6 
 
 
342 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2632  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.59 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  33.49 
 
 
644 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.1 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0499  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.02 
 
 
335 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3277  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.09 
 
 
332 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.944292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  30.83 
 
 
637 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0585  putative hydrolase  31.46 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170793  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2039  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.74 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630421  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0229  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.4 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5980  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  30.38 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>