More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1482 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  94.51 
 
 
328 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
328 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
328 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  97.26 
 
 
328 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  94.51 
 
 
328 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  94.51 
 
 
328 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  95.12 
 
 
328 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  99.7 
 
 
328 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
328 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  88.34 
 
 
328 aa  614  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  88.69 
 
 
328 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  88.69 
 
 
328 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  87.2 
 
 
328 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  87.5 
 
 
328 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  86.28 
 
 
328 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  84.76 
 
 
328 aa  594  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.34 
 
 
329 aa  497  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  70.03 
 
 
326 aa  484  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  67.38 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  67.38 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  63.8 
 
 
339 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  64.02 
 
 
330 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  62.28 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.16 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  63.47 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.59 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.59 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  61.89 
 
 
330 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.89 
 
 
330 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.85 
 
 
327 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.89 
 
 
330 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.85 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.85 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.59 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.91 
 
 
336 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.47 
 
 
330 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.59 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  61.4 
 
 
345 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.54 
 
 
330 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.92 
 
 
330 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.85 
 
 
330 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.61 
 
 
327 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.23 
 
 
326 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.42 
 
 
338 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
330 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  66.89 
 
 
302 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.99 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  60.49 
 
 
330 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.06 
 
 
329 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  60.68 
 
 
327 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.81 
 
 
335 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
324 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.51 
 
 
327 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
327 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.58 
 
 
341 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.49 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.68 
 
 
340 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.23 
 
 
336 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.53 
 
 
356 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  57.28 
 
 
331 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.57 
 
 
338 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.19 
 
 
336 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.29 
 
 
335 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.86 
 
 
325 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.08 
 
 
341 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.49 
 
 
333 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.52 
 
 
335 aa  355  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.7 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  51.38 
 
 
330 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50 
 
 
334 aa  338  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.38 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.77 
 
 
325 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.77 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.38 
 
 
335 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.07 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.16 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  48.77 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.09 
 
 
327 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  47.38 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.01 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.85 
 
 
314 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  45.71 
 
 
331 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.71 
 
 
314 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.41 
 
 
331 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  39.69 
 
 
328 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.3 
 
 
330 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.54 
 
 
331 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.51 
 
 
342 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.63 
 
 
320 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0499  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.93 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.28 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2632  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.36 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.41 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0261  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.39 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0256  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.04 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000442201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0275  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  24.8 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.951792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0227  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  25.22 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0418  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  24.05 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>