More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0449 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  99.69 
 
 
327 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  90.72 
 
 
336 aa  634    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
327 aa  681    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  87.09 
 
 
356 aa  604  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  83.14 
 
 
340 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  83.13 
 
 
327 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  83.84 
 
 
331 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  81.49 
 
 
341 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.99 
 
 
326 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.07 
 
 
346 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.01 
 
 
330 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.93 
 
 
330 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.93 
 
 
330 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.31 
 
 
330 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.31 
 
 
330 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.62 
 
 
330 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.31 
 
 
330 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  72.22 
 
 
330 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  72.7 
 
 
330 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  74.23 
 
 
330 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  72.22 
 
 
330 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  72.22 
 
 
330 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.91 
 
 
327 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  72.22 
 
 
330 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.91 
 
 
330 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.91 
 
 
330 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.3 
 
 
330 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.91 
 
 
327 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.91 
 
 
330 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  71.91 
 
 
330 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.01 
 
 
330 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  69.04 
 
 
327 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.28 
 
 
334 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.68 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.92 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  60.68 
 
 
328 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.99 
 
 
336 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.99 
 
 
328 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.68 
 
 
328 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.68 
 
 
328 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.37 
 
 
328 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.16 
 
 
341 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.37 
 
 
328 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.75 
 
 
328 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.86 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  61.86 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
328 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  60 
 
 
345 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
328 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
328 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
328 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  60.29 
 
 
345 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.13 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.51 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.3 
 
 
329 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.28 
 
 
328 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.83 
 
 
338 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  61.11 
 
 
332 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  61.11 
 
 
332 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.97 
 
 
328 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.52 
 
 
335 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.79 
 
 
324 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  62.88 
 
 
302 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.82 
 
 
326 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.06 
 
 
338 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.38 
 
 
325 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  60.99 
 
 
331 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.94 
 
 
335 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.34 
 
 
335 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.66 
 
 
325 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.35 
 
 
325 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.29 
 
 
325 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.54 
 
 
324 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  53.56 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.25 
 
 
335 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.12 
 
 
333 aa  330  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.23 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  51.85 
 
 
325 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  49.38 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.16 
 
 
338 aa  298  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  49.07 
 
 
333 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48 
 
 
334 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.23 
 
 
314 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.91 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  48.92 
 
 
331 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.58 
 
 
314 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44 
 
 
331 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.69 
 
 
330 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.48 
 
 
331 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.77 
 
 
342 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.83 
 
 
320 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0499  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  24.48 
 
 
335 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0275  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  28.52 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.951792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0261  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  28.12 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0227  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  29.96 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0214  fumarylacetoacetase (fumarylacetoacetate hydrolase)  29.96 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0241  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  29.96 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0254  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  29.96 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.52 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0216  fumarylacetoacetase (fumarylacetoacetate hydrolase)  29.52 
 
 
318 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>