More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0162 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
330 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  98.48 
 
 
330 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  89.06 
 
 
330 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  85.58 
 
 
326 aa  587  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  83.74 
 
 
346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  77.09 
 
 
330 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  77.3 
 
 
330 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.99 
 
 
330 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.07 
 
 
330 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.38 
 
 
330 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.78 
 
 
327 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.78 
 
 
327 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.38 
 
 
330 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.99 
 
 
330 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.38 
 
 
330 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  75.85 
 
 
330 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  76.16 
 
 
330 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  76.16 
 
 
330 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  75.85 
 
 
330 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  76.16 
 
 
330 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  75.85 
 
 
330 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  75.85 
 
 
330 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  74.92 
 
 
330 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  72.7 
 
 
327 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  72.7 
 
 
327 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  72.78 
 
 
327 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
340 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.64 
 
 
356 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  69.42 
 
 
331 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  67.96 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  65.57 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.27 
 
 
328 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.58 
 
 
328 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  62.35 
 
 
329 aa  424  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  62.04 
 
 
328 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.27 
 
 
328 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.35 
 
 
328 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  62.35 
 
 
328 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
328 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
328 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
328 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.04 
 
 
328 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.19 
 
 
328 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.04 
 
 
328 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.73 
 
 
328 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.39 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  61.85 
 
 
332 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  61.85 
 
 
332 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.16 
 
 
326 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  61.06 
 
 
345 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.57 
 
 
328 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.88 
 
 
328 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  61.06 
 
 
345 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.56 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.95 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.26 
 
 
341 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.1 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.44 
 
 
324 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  58.68 
 
 
339 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  60.06 
 
 
331 aa  381  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.68 
 
 
338 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.4 
 
 
335 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  61.2 
 
 
302 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.2 
 
 
329 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.23 
 
 
334 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.46 
 
 
338 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.57 
 
 
335 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.69 
 
 
325 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.83 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.21 
 
 
325 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.91 
 
 
325 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.28 
 
 
335 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.23 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.69 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.6 
 
 
334 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.6 
 
 
338 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.85 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  52.6 
 
 
330 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.08 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  48.15 
 
 
325 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  47.38 
 
 
333 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.31 
 
 
331 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  48.31 
 
 
331 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  44 
 
 
328 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.63 
 
 
314 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.15 
 
 
331 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.62 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.82 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.22 
 
 
331 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0499  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.62 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1208  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.63 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0261  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.02 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.27 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0256  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.71 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000442201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0275  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.02 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.951792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5069  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.71 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0227  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.27 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0214  fumarylacetoacetase (fumarylacetoacetate hydrolase)  27.27 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0254  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.27 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0241  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  27.27 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>