28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2237 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2237  hypothetical protein  100 
 
 
704 aa  1434    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4512  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 
679 aa  243  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4687  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 
682 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0513  hypothetical protein  26.45 
 
 
727 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.403382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3075  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3125  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
785 aa  87.8  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  20.51 
 
 
800 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  22.78 
 
 
805 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  20.25 
 
 
894 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 
822 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
813 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 
812 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
705 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
817 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 
928 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
791 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 
927 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 
814 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
832 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 
766 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
793 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 
810 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 
830 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 
818 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
813 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
820 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.69 
 
 
807 aa  45.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 
821 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>