38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1740 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 638 aa  1243    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 417 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  35.92 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  33.1 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  32.21 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  32.39 
 
 		 153 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 186 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  31.39 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  27.66 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  33.08 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  28.57 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  30 
 
 		 169 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  29.63 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  37.5 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 170 aa  57  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  32.08 
 
 		 187 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  36.76 
 
 		 148 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  33.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.2 
 
 		 149 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.2 
 
 		 149 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  32.89 
 
 		 149 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 178 aa  51.2  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 157 aa  51.2  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  30.37 
 
 		 150 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 171 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  27.94 
 
 		 170 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  27.01 
 
 		 154 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  27.94 
 
 		 170 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  33.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  31.08 
 
 		 166 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  31.9 
 
 		 175 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  29.57 
 
 		 165 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  29.57 
 
 		 165 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  33.76 
 
 		 209 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  28.36 
 
 		 145 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>