125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0541 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0138156  normal  0.166106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0938  hypothetical protein  41.94 
 
 		 120 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0114667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1567  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0436  hypothetical protein  44.17 
 
 		 122 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1331  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  92  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  0.34206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  40.85 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  37.5 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  39.44 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  38.03 
 
 		 600 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  45.21 
 
 		 601 aa  65.5  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  38.03 
 
 		 588 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0008  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.519212  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1853  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  39.44 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  39.44 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  41.43 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  43.84 
 
 		 600 aa  58.5  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  38.57 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  38.03 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 600 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  38.03 
 
 		 590 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  38.24 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  35.21 
 
 		 590 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  35.21 
 
 		 590 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  30.86 
 
 		 604 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  35.21 
 
 		 590 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2307  hypothetical protein  30.14 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187242  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  34.72 
 
 		 584 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0310  hypothetical protein  34.15 
 
 		 99 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.937149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 586 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  34.29 
 
 		 590 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  35.71 
 
 		 592 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  41.43 
 
 		 603 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1060  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.768979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 431 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  30.49 
 
 		 609 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1548  hypothetical protein  28.83 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0469703  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  35.71 
 
 		 611 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  35.71 
 
 		 611 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0334  hypothetical protein  29.35 
 
 		 97 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.780021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.11 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.57 
 
 		 427 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  40.62 
 
 		 600 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 1013 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  31.19 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 576 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 429 aa  45.1  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  34.78 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.55 
 
 		 57 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 		 1126 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.544476  normal  0.369186 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 1013 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  37.25 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  37.14 
 
 		 623 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 653 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.38 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38.71 
 
 		 616 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.3 
 
 		 681 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2345  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 1143 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.932515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 584 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  30.34 
 
 		 606 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  38.24 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.23 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  29.87 
 
 		 604 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  32.14 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3264  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.23 
 
 		 697 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  38.24 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  34.25 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.92 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  29.49 
 
 		 604 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 1116 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 660 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  32.95 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0418  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 1142 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.718645  normal  0.455985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 660 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0593  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 		 445 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2243  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.99 
 
 		 88 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000430291  normal  0.0350481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.88 
 
 		 381 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3247  iron-sulfur cluster-binding protein  32.04 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 942 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  34.33 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  38.46 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.87 
 
 		 886 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 		 426 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  34.94 
 
 		 488 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0570  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42.31 
 
 		 87 aa  42  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.14 
 
 		 405 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0307  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  45.28 
 
 		 85 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.14 
 
 		 242 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>