13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1567 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1567  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407312  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0938  hypothetical protein  58.72 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0114667  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0541  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  111  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0138156  normal  0.166106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1331  hypothetical protein  46.32 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  0.34206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0436  hypothetical protein  41.59 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240294  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0310  hypothetical protein  31.31 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.937149  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0008  hypothetical protein  30.6 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.519212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2307  hypothetical protein  29.13 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187242  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0334  hypothetical protein  30.1 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.780021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1853  hypothetical protein  27.91 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0396  hypothetical protein  31.07 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1548  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0469703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3504  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>