More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5619 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5619  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249023  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5931  transposase  73.42 
 
 
421 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1642  hypothetical protein  61.72 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00443318  hitchhiker  0.00160164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3204  IstB domain protein ATP-binding protein  62.43 
 
 
721 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0227057  hitchhiker  0.0045602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0690  transposase IstA protein, putative  73.86 
 
 
255 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  26.1 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  27.85 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  28.61 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  26.69 
 
 
354 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  25.07 
 
 
390 aa  87  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.37 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  26.82 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  26.82 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  27.3 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  26.76 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2293  Integrase catalytic region  28.19 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0258  Integrase catalytic region  28.19 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2087  Integrase catalytic region  28.19 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.347453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0130  Integrase catalytic region  28.19 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  25.67 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  25.67 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  25.67 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0247  ISRSO6-transposase ORFA protein  26.25 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0946447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2333  ISRSO6-transposase ORFA protein  26.25 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.764175  normal  0.115531 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0451  ISRSO6-transposase ORFA protein  26.25 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886933  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  23.75 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7663  integrase catalytic region  27.85 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  25.51 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  22.74 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  26.29 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  28.14 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  26.29 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  28.14 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  28.14 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  28.14 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  23.62 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  23.62 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  23.62 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  23.62 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  26.26 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  26.26 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  26.13 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  26.13 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  26.13 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  27.99 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  26.3 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  26.3 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  26.3 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  27.22 
 
 
488 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  26.3 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 
504 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  24.91 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  24.91 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  21.94 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  21.94 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  21.94 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  21.94 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  25.6 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  23.87 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  23.87 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  23.87 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  25.63 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  27.08 
 
 
496 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  26.51 
 
 
496 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  27.08 
 
 
496 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  26.21 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  26.21 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  26.08 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  25.51 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>