69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0026 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0026    100 
 
 		 361 bp  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0045    91.76 
 
 		 360 bp  113  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0007    91.76 
 
 		 360 bp  113  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0008    91.67 
 
 		 357 bp  111  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0067    91.67 
 
 		 357 bp  111  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  0.0116195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    86.47 
 
 		 362 bp  105  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    93.85 
 
 		 367 bp  97.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0895.1    90.77 
 
 		 360 bp  81.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285075  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    91.38 
 
 		 359 bp  75.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0034    97.5 
 
 		 355 bp  71.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0410971  normal  0.0338501 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    87.5 
 
 		 358 bp  63.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    95 
 
 		 359 bp  63.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    95 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    95 
 
 		 359 bp  63.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0014    87.1 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683811  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    92.5 
 
 		 363 bp  56  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    92.5 
 
 		 363 bp  56  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    92.5 
 
 		 363 bp  56  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    96.88 
 
 		 377 bp  56  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    92.5 
 
 		 363 bp  56  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    96.88 
 
 		 351 bp  56  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3830  sRNA  96.88 
 
 		 350 bp  56  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    96.77 
 
 		 353 bp  54  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55180  10Sa RNA SsrA (tmRNA)  90.7 
 
 		 352 bp  54  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4696  tRNA-OTHER  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    92.11 
 
 		 384 bp  52  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    90.48 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    94.12 
 
 		 349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R17    94.12 
 
 		 390 bp  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138375  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA65    94.12 
 
 		 392 bp  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  82.35 
 
 		 370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0003    93.94 
 
 		 391 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000332407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0033    88.89 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0098    93.94 
 
 		 398 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5663  tmRNA  93.94 
 
 		 387 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420561  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    90 
 
 		 405 bp  48.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    90 
 
 		 405 bp  48.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    90 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0032    93.75 
 
 		 390 bp  48.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    90 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    90 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    90 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    90 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    90 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    91.67 
 
 		 384 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0016    90 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  90 
 
 		 367 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    90 
 
 		 367 bp  48.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    91.67 
 
 		 384 bp  48.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    90 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    90 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    93.75 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0096    93.55 
 
 		 389 bp  46.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430458  normal  0.0134001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0025    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>