24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0074 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0074    100 
 
 		 358 bp  710    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0049    94.74 
 
 		 360 bp  60  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    96.88 
 
 		 351 bp  56  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    96.88 
 
 		 366 bp  56  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    96.88 
 
 		 389 bp  56  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    96.88 
 
 		 377 bp  56  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    96.88 
 
 		 353 bp  56  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    96.88 
 
 		 359 bp  56  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    92.11 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0003    93.75 
 
 		 391 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000332407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55180  10Sa RNA SsrA (tmRNA)  93.75 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  93.75 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    93.75 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_tm0001    93.75 
 
 		 397 bp  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0098    93.75 
 
 		 398 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4696  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0007    91.67 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0069    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    93.75 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    93.75 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R17    93.75 
 
 		 390 bp  48.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138375  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA65    93.75 
 
 		 392 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5663  tmRNA  93.75 
 
 		 387 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>