11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0007 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0007    100 
 
 		 354 bp  702    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    99.72 
 
 		 356 bp  694    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    87.67 
 
 		 358 bp  73.8  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.97 
 
 		 355 bp  58  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    96.97 
 
 		 366 bp  58  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    96.77 
 
 		 377 bp  54  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    96.77 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    96.67 
 
 		 389 bp  52  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    96.67 
 
 		 349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    96.67 
 
 		 353 bp  52  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    91.67 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>