16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0067 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0067    100 
 
 		 349 bp  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0096    90.91 
 
 		 348 bp  75.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000600137  normal  0.594614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  100 
 
 		 355 bp  60  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    94.12 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3016  10Sa RNA (tmRNA)  96.67 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0007    96.67 
 
 		 354 bp  52  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    96.67 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    96.67 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    96.67 
 
 		 353 bp  52  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    96.67 
 
 		 377 bp  52  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    83.56 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0075    100 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    91.43 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0015    90.7 
 
 		 354 bp  46.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.78504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0041    91.43 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.259798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>