42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_R0092 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_R0092    100 
 
 		 361 bp  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    100 
 
 		 362 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    100 
 
 		 362 bp  71.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    100 
 
 		 362 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    100 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    100 
 
 		 362 bp  71.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    100 
 
 		 360 bp  71.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    100 
 
 		 362 bp  71.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    97.22 
 
 		 363 bp  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    88.33 
 
 		 389 bp  63.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    97.22 
 
 		 363 bp  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    97.22 
 
 		 363 bp  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    92.86 
 
 		 359 bp  60  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    92.86 
 
 		 359 bp  60  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    96.97 
 
 		 354 bp  58  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    96.97 
 
 		 362 bp  58  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    100 
 
 		 363 bp  56  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  94.44 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    94.44 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    94.44 
 
 		 364 bp  56  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    85.71 
 
 		 405 bp  54  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    85.71 
 
 		 405 bp  54  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    96.67 
 
 		 349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.67 
 
 		 355 bp  52  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0034    90.48 
 
 		 355 bp  52  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0410971  normal  0.0338501 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    100 
 
 		 367 bp  50.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    93.75 
 
 		 377 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    93.75 
 
 		 351 bp  48.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    91.67 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  91.67 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  85 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    93.55 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0024    91.43 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0673797  decreased coverage  0.000121403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    100 
 
 		 380 bp  46.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0025    91.43 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    91.43 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>