61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0064 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0064    100 
 
 		 363 bp  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0034    94.87 
 
 		 355 bp  61.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0410971  normal  0.0338501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 367 bp  60  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    100 
 
 		 364 bp  60  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    100 
 
 		 367 bp  60  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    100 
 
 		 361 bp  56  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    94.44 
 
 		 359 bp  56  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    94.44 
 
 		 359 bp  56  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    100 
 
 		 360 bp  54  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  96.77 
 
 		 356 bp  54  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    96.77 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    100 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  96.77 
 
 		 364 bp  54  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    96.77 
 
 		 367 bp  54  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    100 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    100 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0057    92.31 
 
 		 356 bp  54  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    96.67 
 
 		 371 bp  52  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    96.67 
 
 		 364 bp  52  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2226    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0056    96.67 
 
 		 359 bp  52  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  96.67 
 
 		 364 bp  52  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0025    96.55 
 
 		 361 bp  50.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    96.55 
 
 		 362 bp  50.1  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0024    96.55 
 
 		 359 bp  50.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.712325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    96.55 
 
 		 384 bp  50.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    96.55 
 
 		 380 bp  50.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    100 
 
 		 377 bp  48.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    100 
 
 		 378 bp  48.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    100 
 
 		 376 bp  48.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    100 
 
 		 376 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5663  tmRNA  86.27 
 
 		 387 bp  46.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420561  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    96.3 
 
 		 363 bp  46.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0008    93.55 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0895.1    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285075  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0038    93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    86.27 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA65    86.27 
 
 		 392 bp  46.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    96.3 
 
 		 363 bp  46.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0045    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    96.3 
 
 		 363 bp  46.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0014    93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0067    93.55 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  0.0116195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0007    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  91.43 
 
 		 365 bp  46.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    100 
 
 		 384 bp  46.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0042    89.74 
 
 		 354 bp  46.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.396552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>