59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01123 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01123    100 
 
 		 367 bp  728    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  87.53 
 
 		 367 bp  347  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    83.56 
 
 		 364 bp  240  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    86.15 
 
 		 362 bp  157  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    86.15 
 
 		 363 bp  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    86.15 
 
 		 362 bp  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    86.15 
 
 		 363 bp  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    86.71 
 
 		 360 bp  153  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    91.18 
 
 		 364 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  91.18 
 
 		 364 bp  151  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    85.64 
 
 		 363 bp  149  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    85.64 
 
 		 362 bp  149  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    85.64 
 
 		 363 bp  149  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    85.64 
 
 		 363 bp  149  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    85.64 
 
 		 363 bp  141  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    85.64 
 
 		 362 bp  141  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    85.64 
 
 		 363 bp  141  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    85.64 
 
 		 362 bp  141  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    85.64 
 
 		 363 bp  141  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  86.79 
 
 		 363 bp  133  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    88.15 
 
 		 363 bp  133  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    92 
 
 		 380 bp  93.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    86.81 
 
 		 354 bp  77.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    86.75 
 
 		 355 bp  69.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    86.75 
 
 		 355 bp  69.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    86.75 
 
 		 355 bp  69.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    95 
 
 		 362 bp  63.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    94.87 
 
 		 359 bp  61.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    94.87 
 
 		 359 bp  61.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    100 
 
 		 363 bp  60  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0024    85.19 
 
 		 355 bp  58  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0673797  decreased coverage  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    85.19 
 
 		 356 bp  58  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0025    85.19 
 
 		 353 bp  58  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    96.88 
 
 		 378 bp  56  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    88.46 
 
 		 360 bp  56  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    96.88 
 
 		 377 bp  56  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    94.44 
 
 		 361 bp  56  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    90.7 
 
 		 358 bp  54  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0034    92.31 
 
 		 355 bp  54  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0410971  normal  0.0338501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    92.31 
 
 		 384 bp  54  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0100    84.34 
 
 		 353 bp  54  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_002939  GstmRNA1  sRNA  94.12 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0117994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    92.11 
 
 		 367 bp  52  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0026    94.12 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.73285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0063    100 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000276637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    96.67 
 
 		 376 bp  52  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    96.67 
 
 		 376 bp  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  96.55 
 
 		 375 bp  50.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0005    96.55 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0006    91.89 
 
 		 348 bp  50.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0075    84.38 
 
 		 351 bp  48.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    90 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    93.75 
 
 		 371 bp  48.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0033    90 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    91.43 
 
 		 330 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    93.55 
 
 		 403 bp  46.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>