46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_R0034 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0034    100 
 
 		 355 bp  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0410971  normal  0.0338501 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    98.56 
 
 		 359 bp  260  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    98.56 
 
 		 359 bp  260  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    97.5 
 
 		 361 bp  71.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    94.87 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    94.87 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    94.87 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    94.87 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    94.87 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  91.67 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    91.67 
 
 		 360 bp  56  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    92.5 
 
 		 362 bp  56  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    92.31 
 
 		 367 bp  54  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    92.31 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    92.31 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    92.31 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    92.31 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    92.31 
 
 		 364 bp  54  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    92.31 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    92.31 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    96.67 
 
 		 380 bp  52  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    90.48 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    96.55 
 
 		 403 bp  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    90.24 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    96.55 
 
 		 362 bp  50.1  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0025    90.24 
 
 		 353 bp  50.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0024    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0673797  decreased coverage  0.000121403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    96.55 
 
 		 403 bp  50.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0033    88.64 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    93.55 
 
 		 377 bp  46.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0006    100 
 
 		 348 bp  46.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  89.74 
 
 		 364 bp  46.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  91.43 
 
 		 365 bp  46.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    89.74 
 
 		 364 bp  46.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    93.55 
 
 		 378 bp  46.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0005    96.3 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    93.55 
 
 		 376 bp  46.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    93.55 
 
 		 376 bp  46.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0063    100 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000276637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>