62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07640 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07640    100 
 
 
371 bp  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    88.41 
 
 
370 bp  139  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0069    87.3 
 
 
369 bp  115  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  86.46 
 
 
365 bp  79.8  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    100 
 
 
384 bp  61.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    94.59 
 
 
368 bp  58  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    87.72 
 
 
366 bp  58  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0025    80.8 
 
 
370 bp  56  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    89.58 
 
 
370 bp  56  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    90.7 
 
 
371 bp  54  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0008    96.77 
 
 
357 bp  54  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    96.77 
 
 
378 bp  54  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  96.77 
 
 
364 bp  54  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    96.77 
 
 
363 bp  54  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_tm0001    89.36 
 
 
397 bp  54  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0067    96.77 
 
 
357 bp  54  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  0.0116195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    96.77 
 
 
377 bp  54  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  96.77 
 
 
356 bp  54  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0895.1    96.77 
 
 
360 bp  54  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285075  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0045    96.77 
 
 
360 bp  54  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    96.77 
 
 
367 bp  54  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0007    96.77 
 
 
360 bp  54  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371342  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    96.77 
 
 
362 bp  54  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    96.67 
 
 
376 bp  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    96.67 
 
 
384 bp  52  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    96.67 
 
 
376 bp  52  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1398    89.13 
 
 
397 bp  52  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0021    96.67 
 
 
368 bp  52  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    96.67 
 
 
363 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2226    96.67 
 
 
360 bp  52  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    93.75 
 
 
362 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    93.75 
 
 
362 bp  48.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.75 
 
 
360 bp  48.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    93.75 
 
 
352 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    93.75 
 
 
360 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    93.75 
 
 
380 bp  48.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    93.75 
 
 
361 bp  48.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    93.75 
 
 
362 bp  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0056    93.75 
 
 
359 bp  48.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    93.75 
 
 
363 bp  48.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    93.75 
 
 
367 bp  48.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    93.55 
 
 
358 bp  46.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.55 
 
 
425 bp  46.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.55 
 
 
360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    93.55 
 
 
349 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 
405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 
405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0006    93.55 
 
 
348 bp  46.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    93.55 
 
 
359 bp  46.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    93.55 
 
 
358 bp  46.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0100    93.55 
 
 
353 bp  46.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0063    93.55 
 
 
351 bp  46.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000276637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>