64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0023 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0023    100 
 
 		 371 bp  735    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    82.86 
 
 		 373 bp  87.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  97.83 
 
 		 365 bp  83.8  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    92.73 
 
 		 376 bp  77.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    95.65 
 
 		 366 bp  75.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    90.74 
 
 		 384 bp  60  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    92.5 
 
 		 365 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    92.5 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    92.5 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    96.77 
 
 		 383 bp  54  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    90.7 
 
 		 371 bp  54  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    96.77 
 
 		 370 bp  54  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0008    96.77 
 
 		 340 bp  54  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0053    92.11 
 
 		 374 bp  52  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  96.67 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    96.67 
 
 		 374 bp  52  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    96.67 
 
 		 377 bp  52  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    85.48 
 
 		 373 bp  52  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    96.67 
 
 		 330 bp  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  96.67 
 
 		 364 bp  52  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    96.67 
 
 		 378 bp  52  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    96.67 
 
 		 358 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    96.67 
 
 		 362 bp  52  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  96.67 
 
 		 1224 bp  52  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    96.67 
 
 		 384 bp  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    96.55 
 
 		 362 bp  50.1  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0039    100 
 
 		 370 bp  50.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2226    96.55 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    96.55 
 
 		 375 bp  50.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    96.55 
 
 		 376 bp  50.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    96.55 
 
 		 376 bp  50.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0027    96.55 
 
 		 351 bp  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    96.55 
 
 		 384 bp  50.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    93.75 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0005    96.43 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    88.37 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0050    93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    100 
 
 		 368 bp  46.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0060    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0020    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0668776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0037    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0044    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>