28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_R0015 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_R0016    98.12 
 
 		 373 bp  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    100 
 
 		 375 bp  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    86.15 
 
 		 373 bp  115  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    84.85 
 
 		 373 bp  77.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    100 
 
 		 376 bp  67.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    88.68 
 
 		 374 bp  58  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    96.88 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    96.88 
 
 		 367 bp  56  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0050    96.77 
 
 		 360 bp  54  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    85.71 
 
 		 370 bp  54  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0019    85.07 
 
 		 374 bp  54  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126583  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0036    96.67 
 
 		 350 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0043    96.67 
 
 		 350 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0043    96.67 
 
 		 350 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    96.67 
 
 		 365 bp  52  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    94.12 
 
 		 384 bp  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    93.94 
 
 		 383 bp  50.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    93.94 
 
 		 370 bp  50.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.55 
 
 		 371 bp  50.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    91.89 
 
 		 366 bp  50.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    84.38 
 
 		 368 bp  48.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0039    82.67 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0053    93.55 
 
 		 374 bp  46.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    93.55 
 
 		 330 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  93.55 
 
 		 1224 bp  46.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>