14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_R0011 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_R0011    100 
 
 		 367 bp  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    100 
 
 		 367 bp  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    100 
 
 		 365 bp  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    93.72 
 
 		 366 bp  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0039    84.38 
 
 		 370 bp  244  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0053    91.67 
 
 		 374 bp  119  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    90.91 
 
 		 373 bp  97.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    94.44 
 
 		 376 bp  56  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    96.88 
 
 		 375 bp  56  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    92.5 
 
 		 371 bp  56  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    96.67 
 
 		 373 bp  52  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    81.73 
 
 		 373 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0050    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    93.55 
 
 		 368 bp  46.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>