11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0053 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0053    100 
 
 		 374 bp  741    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    91.67 
 
 		 367 bp  119  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    91.67 
 
 		 367 bp  119  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    91.67 
 
 		 365 bp  119  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0039    90.72 
 
 		 370 bp  113  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    90.62 
 
 		 366 bp  111  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    85.71 
 
 		 373 bp  65.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    92.11 
 
 		 371 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    90.24 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    93.75 
 
 		 376 bp  48.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    93.55 
 
 		 375 bp  46.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>