25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0028 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0028    100 
 
 		 373 bp  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    90.91 
 
 		 367 bp  97.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    90.91 
 
 		 367 bp  97.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    90.91 
 
 		 365 bp  97.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    85.71 
 
 		 373 bp  83.8  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    88.31 
 
 		 366 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    84.85 
 
 		 375 bp  77.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0053    85.71 
 
 		 374 bp  65.9  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    83.91 
 
 		 373 bp  61.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    100 
 
 		 376 bp  61.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0039    92.68 
 
 		 370 bp  58  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0019    85.94 
 
 		 374 bp  56  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126583  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0036    96.77 
 
 		 350 bp  54  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0043    96.77 
 
 		 350 bp  54  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0043    96.77 
 
 		 350 bp  54  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0050    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    93.75 
 
 		 374 bp  48.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  93.75 
 
 		 1224 bp  48.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    93.55 
 
 		 383 bp  46.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    96.3 
 
 		 366 bp  46.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    93.55 
 
 		 384 bp  46.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 762 bp  46.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 762 bp  46.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>