19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0016 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0015    98.12 
 
 		 375 bp  684    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    100 
 
 		 373 bp  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    85.94 
 
 		 373 bp  111  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    85.71 
 
 		 373 bp  83.8  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    100 
 
 		 376 bp  65.9  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    87.27 
 
 		 383 bp  54  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    96.67 
 
 		 365 bp  52  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    96.67 
 
 		 367 bp  52  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    85.48 
 
 		 371 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    96.67 
 
 		 367 bp  52  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0036    96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    86.79 
 
 		 374 bp  50.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    91.89 
 
 		 366 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0043    96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0043    96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0050    96.55 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    89.8 
 
 		 370 bp  50.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    93.94 
 
 		 370 bp  50.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    93.75 
 
 		 384 bp  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>