57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_R0046 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_R0046    100 
 
 		 370 bp  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    87.7 
 
 		 383 bp  123  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    88.6 
 
 		 370 bp  115  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    90 
 
 		 373 bp  83.8  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    82.54 
 
 		 384 bp  69.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    86.96 
 
 		 374 bp  65.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 1224 bp  61.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_tm0001    91.49 
 
 		 397 bp  61.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    100 
 
 		 366 bp  60  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1398    92.86 
 
 		 397 bp  60  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    100 
 
 		 358 bp  60  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    100 
 
 		 351 bp  60  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    100 
 
 		 351 bp  60  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    100 
 
 		 330 bp  60  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  83.15 
 
 		 365 bp  58  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0027    100 
 
 		 351 bp  58  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    89.58 
 
 		 371 bp  56  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    85.71 
 
 		 375 bp  54  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0047    96.77 
 
 		 344 bp  54  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0026    96.67 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.73285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    96.67 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    96.67 
 
 		 425 bp  52  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    96.67 
 
 		 352 bp  52  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    96.67 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0025    85.14 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.67 
 
 		 371 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    96.67 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    96.67 
 
 		 405 bp  52  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    96.67 
 
 		 405 bp  52  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    96.67 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0060    96.67 
 
 		 358 bp  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    96.67 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    96.67 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    94.12 
 
 		 376 bp  52  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GstmRNA1  sRNA  96.67 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0117994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0057    96.55 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    96.55 
 
 		 349 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0042    96.55 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.396552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    93.94 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    96.55 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    93.55 
 
 		 373 bp  46.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>