13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0011 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0013  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0536074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0005  tRNA-Arg  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.223597  normal  0.24295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0038  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0002  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0220678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    100 
 
 		 370 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    100 
 
 		 370 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    100 
 
 		 384 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    100 
 
 		 383 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 1224 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    100 
 
 		 374 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    100 
 
 		 373 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>