65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0060 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0060    100 
 
 		 358 bp  710    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  100 
 
 		 365 bp  60  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    97.06 
 
 		 403 bp  60  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    94.44 
 
 		 358 bp  56  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    96.88 
 
 		 403 bp  56  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0056    94.44 
 
 		 359 bp  56  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    96.77 
 
 		 373 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    96.77 
 
 		 384 bp  54  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    96.77 
 
 		 370 bp  54  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    96.77 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    96.77 
 
 		 374 bp  54  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    96.77 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    96.77 
 
 		 330 bp  54  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    96.77 
 
 		 403 bp  54  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0017    96.67 
 
 		 400 bp  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    96.67 
 
 		 383 bp  52  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    94.12 
 
 		 362 bp  52  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    96.67 
 
 		 366 bp  52  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  96.67 
 
 		 1224 bp  52  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0033    96.55 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0055    100 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0024    85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0027    96.55 
 
 		 351 bp  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0759  10Sa RNA  93.94 
 
 		 582 bp  50.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    93.75 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  93.75 
 
 		 370 bp  48.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GstmRNA1  sRNA  93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0117994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    93.55 
 
 		 377 bp  46.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0895.1    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285075  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0036    93.55 
 
 		 359 bp  46.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.777782  normal  0.19234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0045    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    93.55 
 
 		 371 bp  46.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    93.55 
 
 		 367 bp  46.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0008    93.55 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    93.55 
 
 		 378 bp  46.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  0.0304222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0007    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0026    93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.73285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.55 
 
 		 425 bp  46.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0150  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000645582  hitchhiker  0.00000000139269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0067    93.55 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  0.0116195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000368729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0038    93.55 
 
 		 359 bp  46.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765135 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0154  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693037  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>