13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0024 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0024    100 
 
 		 360 bp  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0048    100 
 
 		 365 bp  67.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000306243  normal  0.0564215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0013    100 
 
 		 355 bp  67.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0018    100 
 
 		 367 bp  65.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0712105  normal  0.309951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0075    100 
 
 		 351 bp  58  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    94.29 
 
 		 403 bp  54  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0060    85.96 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0069    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 367 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3830  sRNA  89.74 
 
 		 350 bp  46.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    93.55 
 
 		 403 bp  46.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0001  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>