147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0001 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0014  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0037  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386213  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0040  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  85.53 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0049  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0045  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0024  tRNA-Ala  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0513079  normal  0.0822936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0020  tRNA-Ala  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt21  tRNA-Ala  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.59107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  97.06 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0035  tRNA-Ala  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0025  tRNA-Ala  89.36 
 
 
77 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0017  tRNA-Ala  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0016  tRNA-Ala  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650839  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0052  tRNA-Ala  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353851  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0029  tRNA-Ala  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0038  tRNA-Ala  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882256  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0013  tRNA-Ala  88.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466573  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0044  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.521013  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0047  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0012  tRNA-Ala  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0011  tRNA-Ala  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204027  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0019  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0011  tRNA-Ala  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14037  tRNA-Ala  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.897629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0018  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245872  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0038  tRNA-Ala  91.89 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0037  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0047  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000513142  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0011  tRNA-Ala  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00874285  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0011  tRNA-Ala  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0017  tRNA-Ala  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0035  tRNA-Ala  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>