22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0069 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0069    100 
 
 		 369 bp  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342844  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    87.3 
 
 		 371 bp  115  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20280    86.02 
 
 		 370 bp  81.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.901931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    85.53 
 
 		 366 bp  63.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0025    84.62 
 
 		 370 bp  63.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tmRNA  10Sa RNA  100 
 
 		 351 bp  58  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000526635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    94.12 
 
 		 364 bp  52  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  94.12 
 
 		 367 bp  52  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  94.12 
 
 		 364 bp  52  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    93.75 
 
 		 384 bp  48.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0019    88.64 
 
 		 368 bp  48.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.70554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    93.75 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    93.75 
 
 		 362 bp  48.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0024    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    93.75 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    93.75 
 
 		 380 bp  48.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    93.55 
 
 		 364 bp  46.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0075    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0013    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0018    93.55 
 
 		 367 bp  46.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0712105  normal  0.309951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>