25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0047 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0047    100 
 
 		 344 bp  682    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GstmRNA1  sRNA  100 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0117994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0026    100 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.73285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  96.88 
 
 		 1224 bp  56  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    96.88 
 
 		 374 bp  56  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0046    96.77 
 
 		 370 bp  54  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.6957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0016    96.77 
 
 		 383 bp  54  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    96.77 
 
 		 373 bp  54  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    96.77 
 
 		 384 bp  54  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0066    96.77 
 
 		 370 bp  54  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    96.67 
 
 		 403 bp  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    96.67 
 
 		 403 bp  52  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    96.67 
 
 		 330 bp  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    96.67 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    96.67 
 
 		 366 bp  52  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    96.67 
 
 		 358 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0027    96.55 
 
 		 351 bp  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0005    96.43 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    93.55 
 
 		 403 bp  46.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0053  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  93.55 
 
 		 365 bp  46.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 3363 bp  46.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>