24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0043 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0043    100 
 
 		 350 bp  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0043    100 
 
 		 350 bp  694    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0036    93.1 
 
 		 350 bp  500  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0050    100 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    96.77 
 
 		 373 bp  54  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    94.29 
 
 		 361 bp  54  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0080    96.67 
 
 		 397 bp  52  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    94.12 
 
 		 358 bp  52  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    96.67 
 
 		 376 bp  52  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    96.67 
 
 		 375 bp  52  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    96.55 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0035    93.94 
 
 		 370 bp  50.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.451039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0038    93.75 
 
 		 366 bp  48.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    93.75 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0016    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.55 
 
 		 425 bp  46.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    91.43 
 
 		 330 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    93.55 
 
 		 349 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>