13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0039 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0039    100 
 
 		 370 bp  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    84.38 
 
 		 367 bp  244  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    84.38 
 
 		 367 bp  244  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0010    84.34 
 
 		 365 bp  242  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0014    83.78 
 
 		 366 bp  210  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.158441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    89.42 
 
 		 373 bp  119  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0053    90.72 
 
 		 374 bp  113  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    92.68 
 
 		 373 bp  58  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0038    96.67 
 
 		 366 bp  52  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    100 
 
 		 371 bp  50.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    88.37 
 
 		 376 bp  46.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    82.67 
 
 		 375 bp  46.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0019    91.43 
 
 		 374 bp  46.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126583  normal  0.116616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>