20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0008 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0008    100 
 
 		 340 bp  674    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.77 
 
 		 371 bp  54  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    93.55 
 
 		 363 bp  46.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    93.55 
 
 		 373 bp  46.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0014    93.55 
 
 		 384 bp  46.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    100 
 
 		 384 bp  46.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    100 
 
 		 378 bp  46.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  93.55 
 
 		 364 bp  46.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    100 
 
 		 362 bp  46.1  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    93.55 
 
 		 351 bp  46.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    93.55 
 
 		 330 bp  46.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    100 
 
 		 377 bp  46.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0045    93.55 
 
 		 374 bp  46.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    100 
 
 		 384 bp  46.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    100 
 
 		 376 bp  46.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    100 
 
 		 376 bp  46.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    93.55 
 
 		 362 bp  46.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>