59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A2226 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A2226    100 
 
 
360 bp  714    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  97.22 
 
 
356 bp  63.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    100 
 
 
362 bp  60  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  100 
 
 
364 bp  60  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    100 
 
 
363 bp  60  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    96.77 
 
 
425 bp  54  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    96.67 
 
 
360 bp  52  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    100 
 
 
384 bp  52  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0042    96.67 
 
 
354 bp  52  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.396552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    96.67 
 
 
349 bp  52  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    96.67 
 
 
363 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0100    96.67 
 
 
353 bp  52  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0006    96.67 
 
 
348 bp  52  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0063    96.67 
 
 
351 bp  52  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000276637  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0057    96.67 
 
 
356 bp  52  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    96.67 
 
 
361 bp  52  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    96.67 
 
 
352 bp  52  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    96.67 
 
 
360 bp  52  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    96.67 
 
 
371 bp  52  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    96.67 
 
 
358 bp  52  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    96.67 
 
 
405 bp  52  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    96.67 
 
 
405 bp  52  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    96.67 
 
 
360 bp  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0025    96.55 
 
 
353 bp  50.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0037    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0026    96.55 
 
 
353 bp  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0044    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    96.55 
 
 
369 bp  50.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    96.55 
 
 
369 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    96.55 
 
 
369 bp  50.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    96.55 
 
 
369 bp  50.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0020    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0668776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    96.55 
 
 
384 bp  50.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.55 
 
 
371 bp  50.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0050    96.55 
 
 
356 bp  50.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    96.55 
 
 
361 bp  50.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0042    96.55 
 
 
352 bp  50.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    96.55 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0032    96.55 
 
 
356 bp  50.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    91.67 
 
 
358 bp  48.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0014    91.67 
 
 
356 bp  48.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    91.67 
 
 
358 bp  48.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    100 
 
 
376 bp  46.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    100 
 
 
376 bp  46.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0056    91.43 
 
 
359 bp  46.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    100 
 
 
377 bp  46.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0024    89.74 
 
 
361 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0715243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    100 
 
 
378 bp  46.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>