32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0569 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0569  sRNA  100 
 
 		 375 bp  743    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    86.55 
 
 		 380 bp  85.7  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    90.48 
 
 		 363 bp  77.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    90.48 
 
 		 363 bp  77.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    88.89 
 
 		 362 bp  69.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    88.89 
 
 		 362 bp  69.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    88.89 
 
 		 362 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    88.89 
 
 		 360 bp  69.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    88.89 
 
 		 363 bp  69.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    88.89 
 
 		 380 bp  69.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    87.3 
 
 		 364 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  87.3 
 
 		 364 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    85.71 
 
 		 362 bp  54  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    96.67 
 
 		 354 bp  52  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    96.55 
 
 		 377 bp  50.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    93.94 
 
 		 403 bp  50.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    96.55 
 
 		 367 bp  50.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0025    100 
 
 		 361 bp  50.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0024    100 
 
 		 359 bp  50.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.712325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    96.55 
 
 		 384 bp  50.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    96.55 
 
 		 376 bp  50.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    96.55 
 
 		 376 bp  50.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    96.55 
 
 		 378 bp  50.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0017    93.94 
 
 		 400 bp  50.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    84.13 
 
 		 362 bp  46.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>