17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0024 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_R0025    100 
 
 		 361 bp  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0024    100 
 
 		 359 bp  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.712325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_SetmRNA1  sRNA  90.56 
 
 		 359 bp  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  100 
 
 		 375 bp  50.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0020    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0668776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    93.75 
 
 		 403 bp  48.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0044    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0037    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0025    93.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0026    93.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0017    93.75 
 
 		 400 bp  48.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0050    93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0042    93.75 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>