21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0007 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0007    99.72 
 
 
354 bp  694    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    100 
 
 
356 bp  706    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    87.67 
 
 
358 bp  73.8  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    97.14 
 
 
366 bp  61.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    96.97 
 
 
351 bp  58  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.97 
 
 
355 bp  58  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    96.97 
 
 
377 bp  58  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    96.88 
 
 
389 bp  56  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    96.77 
 
 
353 bp  54  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    96.67 
 
 
349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    92.11 
 
 
358 bp  52  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4696  tRNA-OTHER  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55180  10Sa RNA SsrA (tmRNA)  93.75 
 
 
352 bp  48.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0003    93.75 
 
 
391 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000332407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0098    93.75 
 
 
398 bp  48.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5663  tmRNA  93.75 
 
 
387 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    93.75 
 
 
361 bp  48.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    93.75 
 
 
361 bp  48.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R17    93.75 
 
 
390 bp  48.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138375  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA65    93.75 
 
 
392 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852572  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0096    94.29 
 
 
348 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000600137  normal  0.594614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>