45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0032 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0032    100 
 
 		 377 bp  747    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    92.92 
 
 		 349 bp  157  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    91.96 
 
 		 360 bp  151  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    91.84 
 
 		 352 bp  123  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1939  hypothetical protein  90.8 
 
 		 168 bp  109  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    100 
 
 		 351 bp  65.9  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    100 
 
 		 353 bp  61.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    96.97 
 
 		 356 bp  58  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    96.88 
 
 		 358 bp  56  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    96.88 
 
 		 361 bp  56  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0007    96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.77 
 
 		 355 bp  54  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0036    94.29 
 
 		 360 bp  54  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.143842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    96.67 
 
 		 349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    93.94 
 
 		 366 bp  50.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0032    84.62 
 
 		 390 bp  50.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    93.94 
 
 		 361 bp  50.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0049    96.55 
 
 		 360 bp  50.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    93.75 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    91.67 
 
 		 351 bp  48.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.75 
 
 		 425 bp  48.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    93.75 
 
 		 389 bp  48.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3830  sRNA  93.55 
 
 		 350 bp  46.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  100 
 
 		 1041 bp  46.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    93.55 
 
 		 358 bp  46.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>