24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0050 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0050    100 
 
 		 353 bp  700    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00374528  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0012    95.12 
 
 		 351 bp  65.9  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0032    100 
 
 		 377 bp  61.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    96.88 
 
 		 358 bp  56  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    96.77 
 
 		 361 bp  54  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    96.77 
 
 		 356 bp  54  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.67 
 
 		 355 bp  52  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    96.67 
 
 		 349 bp  52  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0007    96.67 
 
 		 354 bp  52  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0049    96.55 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    93.55 
 
 		 359 bp  46.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0036    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.143842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.55 
 
 		 425 bp  46.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0092    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.320994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    93.55 
 
 		 389 bp  46.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>