10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0096 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0096    100 
 
 
348 bp  690    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000600137  normal  0.594614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0015    95.74 
 
 
354 bp  77.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.78504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    90.91 
 
 
349 bp  75.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0095    93.48 
 
 
347 bp  67.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0036    85.92 
 
 
360 bp  54  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.143842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0041    94.74 
 
 
353 bp  52  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.259798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  96.97 
 
 
355 bp  50.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    96.55 
 
 
330 bp  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    96.55 
 
 
351 bp  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    94.29 
 
 
356 bp  46.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>