16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0041 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0041    100 
 
 		 353 bp  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.259798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0026    84.62 
 
 		 351 bp  145  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00225362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0143    94.44 
 
 		 358 bp  56  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5991    96.77 
 
 		 355 bp  54  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000867142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0147    96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000320912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5276    96.77 
 
 		 355 bp  54  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0573883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5824    96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0003    96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5663    96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0096    94.74 
 
 		 348 bp  52  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000600137  normal  0.594614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_s0641    96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0116    96.55 
 
 		 351 bp  50.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    91.67 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0067    91.43 
 
 		 349 bp  46.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000820138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0036    89.74 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.143842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>