10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0026 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0026    100 
 
 
351 bp  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00225362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0041    84.62 
 
 
353 bp  145  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.259798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0045    94.12 
 
 
358 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0064    93.94 
 
 
330 bp  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00788989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0065    93.94 
 
 
351 bp  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0027    100 
 
 
351 bp  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0027    100 
 
 
351 bp  48.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0075    89.74 
 
 
351 bp  46.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0082    96.3 
 
 
360 bp  46.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000965966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0018    93.55 
 
 
366 bp  46.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>