More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2217 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  94.51 
 
 		 404 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  99.73 
 
 		 404 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  70.72 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  68.87 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  68.78 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  68.51 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  70.33 
 
 		 440 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  59.78 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  59.23 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  59.5 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  57.18 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  57.02 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  51.52 
 
 		 436 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  35.73 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  40.18 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  38.16 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  39.29 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.07 
 
 		 430 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  35.97 
 
 		 446 aa  225  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  33.98 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.2 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.26 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  38.58 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  33.15 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  35.71 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  34.27 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  35.57 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  35.68 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  36.49 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  34.81 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.71 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  35.83 
 
 		 437 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  35.01 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  35.01 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  36.81 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  36.26 
 
 		 439 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  37.29 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  35.73 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.95 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  36.59 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  37.01 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  36.26 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.71 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  35.08 
 
 		 443 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  34.89 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  35.69 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  35.54 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  35.25 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  35.69 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  38.55 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  36.97 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.18 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  32.69 
 
 		 444 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  36.64 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  34.33 
 
 		 441 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  32.97 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.24 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  35.95 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  34.75 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  32.79 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  34.69 
 
 		 440 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.61 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  32.61 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 435 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  34.94 
 
 		 452 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.33 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  32.34 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  32.34 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  34.6 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  36.69 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  32.34 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  32.34 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  33.79 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.61 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  32.96 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30.46 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  34.16 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  33.33 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  33.61 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  32.07 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  35.24 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.89 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  32.07 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  33.61 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0880  integral membrane protein  36.4 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000917875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  34.34 
 
 		 437 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>