More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2493 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  95.04 
 
 
404 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
404 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  99.73 
 
 
365 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  71.82 
 
 
440 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  70.15 
 
 
443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  70.07 
 
 
418 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  69.83 
 
 
418 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  71.46 
 
 
440 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  61.19 
 
 
443 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  60.7 
 
 
442 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  60.7 
 
 
439 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  57.61 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  57.71 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  53.25 
 
 
436 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  35.75 
 
 
442 aa  278  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  36.95 
 
 
446 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  38.94 
 
 
431 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  38.52 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  37.28 
 
 
436 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
433 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  36.54 
 
 
442 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.16 
 
 
442 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.8 
 
 
437 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  38.42 
 
 
446 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  33 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  34.49 
 
 
430 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  36.23 
 
 
455 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 
446 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  36.23 
 
 
430 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
439 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  36.12 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  33.5 
 
 
440 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 
428 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  34.91 
 
 
432 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  36.54 
 
 
458 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  34.65 
 
 
430 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.5 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  34.07 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  34.48 
 
 
441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  34.64 
 
 
446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.83 
 
 
432 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.65 
 
 
437 aa  226  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  33.91 
 
 
435 aa  225  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  34.83 
 
 
432 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 
435 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  34.83 
 
 
432 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  34.83 
 
 
432 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  33.91 
 
 
435 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.07 
 
 
425 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  34.83 
 
 
432 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.84 
 
 
443 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.84 
 
 
443 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  33.66 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  33.66 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  33.66 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  33.66 
 
 
435 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  35.29 
 
 
439 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  35.07 
 
 
432 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  33.74 
 
 
433 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  33.42 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  33.42 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  34.58 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  32.26 
 
 
440 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  33.25 
 
 
446 aa  219  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  33 
 
 
442 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.75 
 
 
442 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.9 
 
 
434 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.75 
 
 
442 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  35.11 
 
 
443 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  36.01 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  33 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.75 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  34.78 
 
 
439 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  32.01 
 
 
440 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.51 
 
 
435 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.51 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.51 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.51 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  34.78 
 
 
439 aa  216  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  34.07 
 
 
436 aa  215  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  33.09 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  34.89 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  32.61 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  33.66 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.57 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  34.24 
 
 
443 aa  212  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  34.63 
 
 
438 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  34.32 
 
 
466 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  30.83 
 
 
437 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  33.65 
 
 
435 aa  209  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  35.02 
 
 
441 aa  209  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  34.21 
 
 
447 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  34.81 
 
 
431 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  33.58 
 
 
441 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  35.44 
 
 
434 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 
438 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 
448 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  33.98 
 
 
440 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>