More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0455 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  100 
 
 
456 aa  926    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  81.4 
 
 
428 aa  704    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  81.16 
 
 
428 aa  682    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  69.2 
 
 
446 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  81.86 
 
 
428 aa  688    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  66.9 
 
 
442 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  67.29 
 
 
433 aa  559  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  64.67 
 
 
442 aa  559  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  46.19 
 
 
437 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  43.47 
 
 
446 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  42.79 
 
 
435 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  43.33 
 
 
435 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  42.33 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  42.33 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  42.33 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  42.33 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  42.33 
 
 
435 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  42.09 
 
 
435 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  42.09 
 
 
435 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  42 
 
 
448 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
435 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  41.65 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  41.61 
 
 
444 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  40.98 
 
 
446 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.62 
 
 
432 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  40.09 
 
 
432 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  39.86 
 
 
432 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  39.86 
 
 
432 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  39.86 
 
 
445 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.95 
 
 
425 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  39.86 
 
 
432 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  39.62 
 
 
432 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 
432 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  39.07 
 
 
451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  39.07 
 
 
451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  39.07 
 
 
451 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  39.16 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  39.07 
 
 
451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  39.24 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  38.39 
 
 
440 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  39.15 
 
 
443 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 
439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  38.88 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  38.53 
 
 
443 aa  309  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  38.3 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  38.26 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  38.03 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  38.03 
 
 
442 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  37.79 
 
 
442 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  37.79 
 
 
442 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  38.03 
 
 
442 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  39.63 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  36.78 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  42.66 
 
 
361 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  42.66 
 
 
361 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.95 
 
 
442 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 
428 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1548  hypothetical protein  41.9 
 
 
434 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  38.16 
 
 
443 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  37.44 
 
 
437 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  37.18 
 
 
444 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  38.11 
 
 
437 aa  282  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.41 
 
 
430 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  36.28 
 
 
434 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 
464 aa  276  7e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 
449 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  38.26 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.27 
 
 
446 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  38.87 
 
 
449 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  38.87 
 
 
449 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  34.67 
 
 
434 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  35.9 
 
 
442 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 
443 aa  262  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  35.39 
 
 
440 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.74 
 
 
433 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  34.17 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  34.79 
 
 
463 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  35.4 
 
 
443 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  34.59 
 
 
439 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  32.7 
 
 
574 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  33.96 
 
 
443 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
442 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  34.85 
 
 
446 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  35.06 
 
 
446 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  34.95 
 
 
446 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
447 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  31.95 
 
 
503 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  34.73 
 
 
446 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  34.73 
 
 
446 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 
418 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  33.11 
 
 
443 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  35.76 
 
 
418 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4894  hypothetical protein  31.83 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149566  hitchhiker  0.000112878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4386  hypothetical protein  32.49 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  0.867056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  34.93 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.13627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>