186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0539 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.742431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  77.91 
 
 		 269 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  65.52 
 
 		 269 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  56.32 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  56.32 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  56.32 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  56.32 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 268 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 268 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 268 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 268 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 268 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  54.55 
 
 		 268 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  55.68 
 
 		 281 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  54.76 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  52.87 
 
 		 213 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  52.87 
 
 		 243 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  43.08 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  40.28 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  40.28 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  47.54 
 
 		 276 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  40.28 
 
 		 274 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  40.28 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  40.28 
 
 		 274 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  40.98 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  47.54 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  44.26 
 
 		 278 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 274 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 274 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  43.28 
 
 		 274 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  41.94 
 
 		 280 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  40.32 
 
 		 265 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  41.94 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  41.94 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  41.94 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  41.94 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  41.94 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  40.32 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  41.94 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  39.06 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  39.06 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  40.32 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  40.68 
 
 		 275 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  36.51 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  40.98 
 
 		 298 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  40.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  36.07 
 
 		 274 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 		 268 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>